FST, DU, master 2, thèse de sciences… Comment sʼy retrouver ?

Publié le 21 oct. 2026 à 10:07
Article paru dans la revue « Anainf- NeuroFil » / ANAINF N°60

Master 2 : le mode dʼemploi pour les internes en neurologie

Faire un Master 2 pendant son internat, cʼest une année un peu à part : une occasion de sortir de la clinique pour se confronter concrètement à la recherche. Mais entre le choix du master, la recherche dʼun laboratoire et les demandes de financement, il faut sʼy prendre suffisamment tôt. Alors, par où commencer ?

Quand peut-on faire un Master 2 ?

Le Master 2 peut être réalisé pendant lʼinternat (après 4 ou 6 semestres validés), ou à lʼissue de celui-ci. Le moment idéal dépend surtout du projet de chacun : certains souhaitent rapidement découvrir la recherche, tandis que dʼautres préfèrent attendre dʼavoir identifié une thématique ou une équipe qui leur plaît.

Dans tous les cas, en neurologie, il faut prévoir une année de coupure dans lʼinternat. Cette année de M2 ne correspond pas à une « disponibilité ».

Quels sont les prérequis ?

Le principal prérequis est dʼavoir validé un Master 1 (M1). Attention cependant : certaines universités demandent la validation dʼun nombre minimal de crédits ECTS qui ne correspond pas toujours aux ECTS que vous avez validé avec votre M1 (en particulier sʼil sʼagit de deux universités différentes entre M1 et M2).

Comment choisir son Master 2 ?

Cʼest probablement la première grande question à se poser… et il nʼexiste pas de réponse unique !

Commencez par réfléchir à ce qui vous intéresse : quelle thématique particulière en neurologie ? et ensuite quel type de recherche (fondamentale, imagerie, clinique…) ?

vaillant sur les thématiques qui vous intéressent (sur les sites internet des instituts de recherche, sur les réseaux sociaux..), consulter les publications récentes des laboratoires (Pubmed), et contacter directement les chercheurs ou responsables dʼéquipe.

Nʼhésitez pas à demander un rendez- vous pour discuter dʼun éventuel projet de stage. Un premier contact ne vous engage à rien et permet surtout de voir si le sujet, lʼéquipe et lʼenvironnement de recherche vous correspondent.

Et il nʼest pas nécessaire de faire son M2 dans la même ville que son internat ; et les cours du master et le laboratoire de stage peuvent être dans deux villes différentes.

Quand faut-il commencer à constituer son dossier ?

La réponse est simple : tôt ! Idéalement, les premières démarches doivent commencer environ un an avant le début du M2.

Il faut notamment avoir le temps de :

1. Choisir son master ;

2. Trouver une équipe de recherche ;

3. Discuter et définir un projet de stage ;

4. Se renseigner sur les financements ;

5. Déposer les demandes de bourse dans les délais ;

6. Puis finaliser les démarches universitaires et administratives.

Les demandes de financement ont souvent des dates limites bien avant le début de lʼannée universitaire. Il serait dommage de trouver le projet parfait… mais de découvrir trop tard que la candidature à la bourse est déjà clôturée !

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Comment financer son année de Master 2 ?

Plusieurs possibilités existent pour financer son année.

Le principal financement repose sur les bourses. En général, les internes de neurologie candidatent à la bourse proposée par les JNLF, qui permettent de bénéficier de financements issus de différentes sociétés savantes, ainsi quʼà la bourse « Année-Recherche » proposée par lʼARS, selon les modalités de votre subdivision. Vous candidatez pour plusieurs bourses, mais vous ne pourrez en percevoir quʼune seule (pas de cumulation possible). Il existe également dʼautres bourses, nʼhésitez pas à contacter vos référents locaux.

Dʼautres solutions peuvent également être envisagées selon votre situation (en complément des bourses), comme la poursuite des gardes ou les remplacements (si vous avez validé 5 semestres).

Le point important est donc dʼanticiper les démarches et de bien vérifier les dates limites de chaque dispositif.

Pour les bourses JNLF, les modalités de candidature sont disponibles sur le site des JNLF (https://www.jnlf.fr/jeunes/ bourses/demande-bourse-2026).

Et concrètement, comment se déroule lʼannée ?

Lʼorganisation varie selon les masters, mais lʼannée comprend généralement une première période de cours théoriques, souvent dʼenviron trois mois, suivie dʼun stage de recherche en laboratoire dʼenviron six mois.

Les cours peuvent débuter à des dates différentes selon les universités, certains masters commençant en septembre, dʼautres en novembre, avec une organisation généralement adaptée au parcours des internes.

Des évaluations permettent ensuite de valider la partie théorique, généralement courant décembre-janvier, avant de commencer le stage de recherche. Le stage est lʼoccasion de sʼimmerger réellement dans le quotidien dʼune équipe de recherche : participer à un projet, réaliser des analyses, interpréter les résultats et apprendre à composer avec les résultats… y compris lorsquʼils ne sont pas ceux que lʼon attendait !

À la fin du stage, il faudra rédiger un mémoire, puis le présenter lors dʼune soutenance orale pour valider le M2.

Que peut apporter un Master 2 ?

Au-delà du diplôme, le M2 est surtout lʼoccasion de tester la recherche « pour de vrai ». Cʼest une manière de savoir si cet univers vous plaît : pendant plusieurs mois, vous êtes impliqués sepdans un projet, accompagnés par une équipe, mais aussi confrontés aux expériences, aux résultats inattendus, aux échecs et aux incertitudes qui font partie du quotidien de la recherche.

Cʼest également une bonne occasion de :

  • Rencontrer des chercheurs et découvrir leur quotidien ;

  • Participer à des projets scientifiques enrichissants ;

  • Développer ses compétences en méthodologie et en recherche ;

  • Commencer à construire un réseau dans le domaine qui nous intéresse ;

  • Et éventuellement faire émerger un projet de thèse de sciences.

Pour celles et ceux qui souhaitent poursuivre dans la recherche, le M2 constitue une étape obligatoire pour sʼorienter vers une thèse de sciences. Celleci nécessitera ensuite de construire un projet avec un directeur de recherche et une école doctorale, et de trouver un financement (plus dʼinfos : https://anainf.fr/article/these/).

Enfin, le M2 est souvent demandé pour accéder à un poste de Chef de Clinique Assistant (CCA) dans certains services (mais pas obligatoire !)

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Alors, par où commencer ?

Si lʼidée dʼun M2 vous trotte dans la tête, le plus simple est probablement de commencer par en parler autour de vous. Un chef de service, un PU-PH, un ancien interne ayant fait un M2 ou un chercheur peuvent souvent vous aider à identifier les équipes et les thématiques qui pourraient vous correspondre. Et surtout, ne pas attendre dʼavoir un projet parfaitement défini pour prendre contact : les discussions avec les équipes permettent justement de faire mûrir son projet.

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DU, DIU, FST et options : quelles formations complémentaires pendant lʼinternat ?

Le DES de neurologie permet déjà dʼacquérir une formation large, mais il est possible de compléter son parcours en se formant plus spécifiquement dans certains domaines. Plusieurs possibilités existent : les DU/DIU, les Formations Spécialisées Transversales (FST) et les options.

DU ou DIU : de quoi parle-t-on ?

Les Diplômes Universitaires (DU) et Diplômes Inter-Universitaires (DIU) permettent de se former plus spécifiquement dans un domaine particulier, avec une formation principalement théorique et, selon les diplômes, une partie pratique.

La différence entre les deux est assez simple : un DU est porté par une seule université, tandis quʼun DIU est organisé par plusieurs universités.

Les modalités dʼenseignement sont variables : les cours peuvent être proposés en présentiel, en ligne ou sous une forme mixte. Pour certains DIU, les enseignements peuvent également avoir lieu dans plusieurs villes.

Certains diplômes comprennent un stage pratique dans un service agréé, qui est nécessaire pour valider la formation.

Les DU et DIU se déroulent généralement sur un ou deux ans, en parallèle de lʼinternat, avec des examens le plus souvent organisés en fin dʼannée universitaire, notamment au mois de juin.

À noter : il sʼagit de formations payantes, avec des tarifs variables selon les diplômes.

Comment choisir son DU ou son DIU ?

Lʼoffre est très large et il existe des formations dans de nombreux domaines de la neurologie.

Le choix dépend donc surtout de votre projet : approfondir une thématique qui vous intéresse particulièrement, préparer une future activité ou simplement compléter votre formation dans un domaine que vous souhaitez mieux connaître.

Pour trouver le diplôme qui vous correspond, vous pouvez consulter les sites des différentes facultés et universités. Nous essayons également de maintenir une liste des DU et DIU utiles pour les internes en neurologie sur notre site.

Il faut envoyer un CV et une lettre de motivation au responsable du DU selon la deadline (en général avec la rentrée de septembre).

Et les FST et options ?

Les Formations Spécialisées Transversales (FST) et les options permettent également dʼapprofondir un domaine particulier au cours de lʼinternat.

Elles comportent deux stages supplémentaires, réalisés en plus des stages prévus dans le cadre du DES.

La différence entre les deux tient à leur organisation : une FST est commune à plusieurs DES alors quʼune option est spécifique à un DES.

Pour les internes en neurologie, la seule option disponible est « Traitement interventionnel de lʼischémie cérébrale aiguë ».

Les FST sont nombreuses, et vous trouverez des témoignages dʼinternes dans le dossier dédié !

Comment sʼinscrire à une FST ou à une option ?

Il faut là encore anticiper !

Conformément à la réglementation en vigueur, lʼétudiant doit confirmer ses voeux dʼoption ou de FST auprès de son coordonnateur de DES 7 mois avant le début de la FST ou de lʼoption.

Il est donc important de se renseigner suffisamment tôt sur les formations proposées, leurs modalités et les dates de candidature.

À retenir

DU / DIU

  • Approfondir une thématique particulière.

  • Formation théorique, parfois pratique.

  • 1 à 2 ans. q En parallèle de lʼinternat.

  • Formation payante.

FST / option

  • Acquérir une compétence dans une sur-spécialité particulière.

  • 2 stages supplémentaires.

  • À anticiper : voeux à confirmer auprès du coordonnateur de DES 7 mois avant le début.

Et surtout : il existe de nombreuses possibilités pour personnaliser son parcours. Le choix dépend avant tout de votre projet professionnel, de vos centres dʼintérêt et de la façon dont vous envisagez votre exercice futur.

Et si je faisais un stage à lʼétranger pendant mon internat ?

Envie de partir quelques mois dans un service de neurologie à lʼétranger, de découvrir une autre façon de travailler ? Cʼest tout à fait possible pendant lʼinternat !

Mais selon votre projet, les démarches et les modalités de financement peuvent être différentes. Voici les principales choses à savoir.

À partir de quand peut-on partir ?

Pour réaliser un stage à lʼétranger, il faut avoir validé au moins 4 semestres dʼinternat.

Il est ensuite possible de partir dans le cadre dʼun stage qui pourra, sous certaines conditions, être reconnu comme validant pour le DES.

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Comment faire valider son stage à lʼétranger ?

Pour quʼun stage à lʼétranger puisse être considéré comme un stage validant de DES, il doit avoir une durée minimale de 6 mois, comme un stage classique de DES.

Il est possible de réaliser au maximum deux stages à lʼétranger au cours de lʼinternat.

La validation ne se fait pas automatiquement : votre projet doit être soumis à une commission de validation, dont la composition dépend des modalités locales et associe notamment lʼARS, le CHU et la faculté.

Il faudra constituer un dossier comprenant notamment :

  • Les objectifs pédagogiques du stage ; CV et lettre de motivation ;

  • Une lettre dʼaccord du médecin ou responsable de lʼéquipe dʼaccueil ;

  • Une lettre dʼaccord du coordonnateur de DES ;

  • Lʼaccord de votre faculté / doyen.

Les modalités précises pouvant varier selon les subdivisions, nʼhésitez pas à vous rapprocher de vos référents locaux et de votre coordonnateur de DES avant de commencer les démarches.

Qui finance mon stage ?

Si le stage est accepté comme stage validant, il est possible, dans certaines situations, de continuer à être rémunéré par son CHU dʼorigine.

Attention cependant : ce financement nʼest pas garanti et peut notamment dépendre du contexte local et des possibilités de votre établissement. Il faut donc impérativement se renseigner en amont auprès de son CHU et de sa subdivision.

Dʼautres solutions peuvent être envisagées : candidater à une bourse, ou, selon les possibilités, être rémunéré directement par le service dʼaccueil.

Là encore, mieux vaut anticiper : les demandes de financement ont souvent leurs propres calendriers.

Et si mon stage dure moins de 6 mois ?

Cʼest également possible !

Si votre stage ne remplit pas les conditions pour être validant - par exemple parce quʼil dure moins de 6 mois - vous pouvez envisager de partir en disponibilité et réaliser un stage non validant.

Cʼest notamment le cas de certains stages cliniques ou stages de recherche proposés par des sociétés savantes européennes, dont la durée peut être inférieure à 6 mois.

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Par exemple, lʼEuropean Academy of Neurology (EAN) propose régulièrement des opportunités de fellowship (clinique ou recherche) et de formation à lʼétranger.

Ces stages ne comptent alors pas comme un stage de DES, mais peuvent être une excellente occasion de découvrir un autre système de santé, une équipe internationale ou un domaine de recherche particulier.

Comment trouver un stage à lʼétranger ?

Plusieurs possibilités existent : contacter directement une équipe étrangère qui travaille dans un domaine qui vous intéresse, passer par votre chef de service ou profiter des programmes proposés par les sociétés savantes.

Dans tous les cas, commencez les démarches suffisamment tôt : trouver une équipe dʼaccueil, définir le projet, obtenir les accords nécessaires et trouver un financement peut prendre plusieurs mois.

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Pour aller plus loin

Pour retrouver les démarches détaillées pour effectuer un stage à lʼétranger, consultez notre page dédiée :
https://anainf.fr/article/faire-un-stage-a-letranger/

Pour découvrir les opportunités de fellowship et de financement proposées par lʼEuropean Academy of Neurology :
https://www.ean.org/learn/fellowships-and-funding

En savoir plus sur les SFT en Neurologie et comment bien débuter sa formation en internat de neurologie dans le Neurofil numéro 2

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Alexandra DUPIC
Interne en 3ème semestre
Ile-de-France

Publié le 1792570044000